arXiv 人工智能· Shikun Feng, Zipeng Yang, Qiuyi Li, Mingze Yin, Xiaoyuan Zhang, Tingjun Hou, Yiheng Zhu·· 17 時間前AI スコア39
BridgeDock:利用扩散桥将生成式协同折叠先验用于分子对接
BridgeDock: Taming Generative Co-Folding Prior for Molecular Docking with Diffusion Bridge
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AI ガイド
研究人员提出 BridgeDock 框架,通过将 apo 到 holo 的转变建模为扩散桥,将预训练协同折叠模型适配于柔性分子对接。该方法引入对齐机制将桥状态映射至预训练去噪调度,允许从初始蛋白-配体状态而非高斯噪声直接生成复合物。实验显示其在标准柔性对接基准上优于协同折叠基线,推理计算高效且在极少去噪步数下仍保持有效。
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