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arXiv 机器学习· Niousha Sadjadi, Arman Seyed-Ahmadi, Tony Tu, Micaela Elisa Consens, Kerr Ding, Alif Munim, Lila Kari, Zehui Li, Barry B. Rubin, Bo Wang, Vallijah Subasri·· 19 時間前AI スコア35

IsoAlign:基于联合嵌入预测架构的同工型感知 DNA-蛋白质对齐

IsoAlign: Isoform-Aware DNA-Protein Alignment via Joint-Embedding Predictive Architectures

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AI ガイド

IsoAlign 提出了一种通过同工型感知 DNA-蛋白质对齐改进基因组基础模型(GFM)预训练的多模态框架。该框架基于联合嵌入预测架构(JEPA),包含用于对比对齐预测蛋白质表征的 DP-JEPA,以及通过掩码蛋白质预测建模同一基因不同同工型关系的 IM-JEPA。实验表明,该方法在致病性预测、适应度、基因表达和 TF 结合等下游任务中显著提升了表征性能。

出典:arXiv 机器学习 · arxiv.org