arXiv 机器学习· Bing Hu, Sun Sun, Shaik Salman Basha, Anita Layton, Helen Chen·· 15 小时前AI 评分34
DELBERT-2：用于 DEL 蛋白质结合物预测的预训练分子指纹语言模型
DELBERT-2: Pretrained Fingerprint Language Models for DEL Protein Binder Prediction
AI 导读
DELBERT-2 采用 ModernBERT 编码器在 2.5M 分子数据上进行掩码语言建模预训练，可将稀疏分子指纹转换为统一 token 序列以预测 DEL 蛋白质结合物。在 6 个靶点的分布外测试中，其 PR-AUC 与 NDCG@1000 均优于 LightGBM 等基线，Top-100 富集因子达到 13.28±3.72，相关代码已开源。
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