研究人员提出单细胞基因调控多尺度模型MUSS
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2026年11月6日，研究人员在arXiv公布了面向单细胞基因调控的多尺度序列模型MUSS。该模型能联合表征DNA序列、染色质可及性与基因表达，同时保留DNA级与细胞级分辨率。在技术实现上，MUSS利用冻结的预训练编码器并结合peak掩码语言建模，在配对的scATAC-seq与scRNA-seq数据上完成训练，能够预测训练中未见基因和peak的表达。评测结果显示，该模型在基因表达预测、增强子-基因链接及零样本细胞聚类等多项任务中表现优异。目前，MUSS的相关代码与模型已正式公开。
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- arXiv 人工智能MUSS：面向单细胞基因调控的多尺度序列模型
单细胞基因调控模型 MUSS 能联合表征 DNA 序列、染色质可及性与基因表达，同时保留 DNA 级与细胞级分辨率。该模型利用冻结的预训练编码器结合 peak 掩码语言建模，在配对 scATAC-seq 与 scRNA-seq 数据上训练，可预测训练中未见基因和 peak 的表达。其在基因表达预测、增强子-基因链接及零样本细胞聚类等多任务中表现优异，代码与模型已公开。
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