用于蛋白质界面设计的离散与 SE(3) 联合扩散模型

研究人员提出多模态扩散框架 PIDiff，通过耦合离散序列空间扩散与连续 SE(3) 结构流形扩散，联合设计以靶标为条件的蛋白质序列与结构。该框架核心采用结合几何感知不变点注意力与全局序列自注意力的 PIFormer 架构，并在基于 PDB 构建的数据集 PIBench 上进行预训练。